基于线粒体Cytb及CO Ⅰ基因的黄河上游大鼻吻鮈(Rhinogobio nasutus)遗传多样性与系统发育关系分析

王彩雯, 穆爱娟, 王吉祥, 王永杰, 刘彦斌, 刘凯, 肖伟, 刘哲, 连总强

基因组学与应用生物学 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (Z2) : 1826 -1835.

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基因组学与应用生物学 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (Z2) : 1826 -1835. DOI: 10.13417/j.gab.043.001826

基于线粒体Cytb及CO Ⅰ基因的黄河上游大鼻吻鮈(Rhinogobio nasutus)遗传多样性与系统发育关系分析

    王彩雯, 穆爱娟, 王吉祥, 王永杰, 刘彦斌, 刘凯, 肖伟, 刘哲, 连总强
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摘要

为研究黄河上游不同群体大鼻吻鮈遗传结构与系统发育关系,保护其野生种质资源,本研究基于线粒体Cytb和COⅠ基因对黄河宁夏段及内蒙古段4个地理群体的大鼻吻鮈进行了遗传多样性及系统发育关系分析。结果表明,Cytb和COⅠ基因序列长度分别为1 145、 749 bp,两个序列串联后的组合序列长度为1 894 bp,碱基组成均呈现明显的AT偏倚性。4个地理种群中,线粒体Cytb和COⅠ序列具有8个组合多态位点及9个组合单倍型,平均单倍型多样性(Hd)0.776,平均核苷酸多样性(π)为0.000 78。分子方差分析(analysis of molecular variance, AMOVA)显示4个地理种群间无显著遗传分化,其中95.81%变异来自群体内部,4.18%变异来自群体间。系统发育树及单倍型网络图表明大鼻吻鮈遗传结构比较单一,错配分布结果表明大鼻吻鮈在历史上出现过群体扩张事件。综上所述,黄河中上游的大鼻吻鮈群体遗传结构单一、遗传多样性较低,有必要将其作为一个保护单元进行就地保护,以期丰富大鼻吻鮈种群的遗传多样性。

关键词

大鼻吻鮈 / Cytb / CO Ⅰ / 遗传多样性

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基于线粒体Cytb及CO Ⅰ基因的黄河上游大鼻吻鮈(Rhinogobio nasutus)遗传多样性与系统发育关系分析[J]. 基因组学与应用生物学, 2024, 43(Z2): 1826-1835 DOI:10.13417/j.gab.043.001826

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