基于线粒体Cytb及CO Ⅰ基因的黄河上游大鼻吻鮈(Rhinogobio nasutus)遗传多样性与系统发育关系分析

摘要

为研究黄河上游不同群体大鼻吻鮈遗传结构与系统发育关系，保护其野生种质资源，本研究基于线粒体Cytb和COⅠ基因对黄河宁夏段及内蒙古段4个地理群体的大鼻吻鮈进行了遗传多样性及系统发育关系分析。结果表明，Cytb和COⅠ基因序列长度分别为1 145、 749 bp,两个序列串联后的组合序列长度为1 894 bp,碱基组成均呈现明显的AT偏倚性。4个地理种群中，线粒体Cytb和COⅠ序列具有8个组合多态位点及9个组合单倍型，平均单倍型多样性（H_d）0.776,平均核苷酸多样性（π）为0.000 78。分子方差分析（analysis of molecular variance, AMOVA）显示4个地理种群间无显著遗传分化，其中95.81%变异来自群体内部，4.18%变异来自群体间。系统发育树及单倍型网络图表明大鼻吻鮈遗传结构比较单一，错配分布结果表明大鼻吻鮈在历史上出现过群体扩张事件。综上所述，黄河中上游的大鼻吻鮈群体遗传结构单一、遗传多样性较低，有必要将其作为一个保护单元进行就地保护，以期丰富大鼻吻鮈种群的遗传多样性。

关键词

大鼻吻鮈 / Cytb / CO Ⅰ / 遗传多样性

基金资助

宁夏重点研发计划项目(2023BCF01013); 农业农村部财政专项(HHDC-2022-02)共同资助