摩拉水牛和尼里拉菲水牛不同颜色眼睛差异表达基因分析

摘要

蓝宝石眼睛是尼里拉菲水牛的重要品种特征。为了研究水牛不同颜色眼睛的基因表达模式，本研究对黑色瞳色的摩拉水牛和蓝色瞳色的尼里拉菲水牛的眼睛进行RNA测序（RNA sequencing, RNA-seq）,并以|log₂FC|≥2且P<0.05为筛选标准，对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析，进一步对通路上的基因进行蛋白质互作分析。结果显示，有1 708个基因在摩拉水牛眼睛和尼里拉菲水牛眼睛之间有差异表达。富集分析显示，差异表达基因主要富集在黑色素生成、酪氨酸代谢、半胱氨酸代谢和光传导等通路。本研究还挖掘出多个与眼睛光传导和黑色素生成相关的关键差异基因，确定了KIT、MGST1、GNGT1和TYRP1等在功能网络中高度互联的核心基因。本研究为尼里拉菲水牛蓝色瞳色形成的分子调控机制提供了参考，扩展了对水牛眼睛中黑色素沉积的生物学认识。

关键词

水牛(Bubalus bubalis) / 眼睛 / 黑色素 / 转录组