嗜黏蛋白阿克曼菌分离株全基因组及生物学特性分析

摘要

为了解前期实验室分离的嗜黏蛋白阿克曼菌（Akkermansia muciniphila, AKK）基因及生物学特性，本研究分析了2株人源AKK分离株（SDLYAKK5和SDLYAKK8）的全基因组及泛基因组、生长特性、碳源利用能力、环境氧耐受能力、体外抑菌能力及代谢产物。结果表明，两分离株全长均为2.8 Mb左右，但两者平均核苷酸相似度（average nucleotide identity, ANI）为97.52%,表明两分离株属于不同亚种。菌株泛基因组基因有7 284个，核心基因有195个。两分离株稳定期OD₆₀₀均为1.140左右，都可以代谢95种碳源中的23种，但SDLYAKK8分离株的耐受环境氧气能力及抑菌能力显著高于SDLYAKK5的。同时利用非靶代谢组学技术分析了两分离株在培养基中发酵代谢产物，结果表明SDLYAKK8分离株可以产生更多的γ-氨基丁酸、 N-乙酰血清素等物质，而SDLYAKK5可以产生更多的泛酸、米格列醇等多种功能性代谢产物。本研究结果为两分离株后续进一步的开发利用提供了数据支撑。

关键词

嗜黏蛋白阿克曼菌 / 全基因组 / 泛基因组 / 生物学特性 / 非靶代谢组学