基于COⅠ基因分析长江中下游陈氏新银鱼群体遗传多样性

摘要

长江中下游地区生境多样，是陈氏新银鱼（Neosalanx tangkahkeii）的核心分布区域。为深入了解不同生境下陈氏新银鱼的遗传多样性和遗传分化情况，本研究利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ（cytochrome c oxidaseⅠ,COⅠ）基因序列作为遗传标记，对来自长江中下游泰州（Taizhou, TZ）、南京（Nanjing, NJ）、安庆（Anqing, AQ）、湖口（Hukou, HK）4个江段，以及鄱阳湖（Poyang Lake, PY）和洞庭湖（Dongting Lake, DT）2个通江湖泊的6个陈氏新银鱼群体进行了遗传多样性研究。研究结果表明，6个群体共检测出12个单倍型，单倍型多样性范围和核苷酸多样性范围分别为0.074～0.725, 0.000 28～0.002 02。6个群体的遗传多样性水平表现为PY群体最高，DT群体次之，然后依次是NJ、 AQ、 TZ和HK群体，群体间的遗传距离范围为0.000 46～0.001 96, NJ和PY群体之间的遗传距离最大，AQ群体和HK群体之间的遗传距离最小，不符合地理分布格局。群体间遗传分化系数F_st及遗传距离分析结果表明，PY和DT群体与其他群体的遗传距离相对较远。分子系统树和单倍型网络进化分析显示，PY和DT群体聚为一个分支。AMOVA分析发现，遗传变异主要来自群体内，中性检验、错配分布图及BSP（Bayesian skyline plot）结果表明陈氏新银鱼群体可能出现过群体扩张。

关键词

陈氏新银鱼 / 遗传多样性 / 细胞色素c氧化酶Ⅰ(COⅠ)基因