核桃JrSnRK基因家族全基因组鉴定及非生物胁迫后的表达分析

赵奇龙; 王斌; 骆翔; 赵钰; 韩立群; 阿不都苏甫尔·吾甫尔江; 马凯; 全绍文

doi:10.13417/j.gab.045.000050

基因组学与应用生物学 ›› 2026, Vol. 45 ›› Issue (01) : 50 -64. DOI: 10.13417/j.gab.045.000050

核桃JrSnRK基因家族全基因组鉴定及非生物胁迫后的表达分析

赵奇龙, 王斌, 骆翔, 赵钰, 韩立群, 阿不都苏甫尔·吾甫尔江, 马凯, 全绍文

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摘要

蔗糖非发酵-1相关蛋白激酶(sucrose non-fermenting-1 related protein kinase,SnRK)基因在植物中广泛分布，其编码的蛋白激酶通过磷酸化作用调节靶蛋白活性，从而协调多种生理信号通路，在植物应对胁迫过程中发挥关键作用。本研究利用生物信息学方法，筛选并鉴定了核桃(Juglans regia) Jr SnRK基因家族成员，分析了其理化性质、染色体定位、进化关系和基因表达模式等。结果表明，在核桃中共鉴定到40个Jr SnRK基因家族成员，并将其分为3个亚家族，每个亚家族中分别含有2个Jr SnRK1、13个Jr SnRK2和25个Jr SnRK3成员，蛋白质氨基酸序列长度在267～940 aa之间。40个Jr SnRK基因家族成员不均匀地分布在15条染色体上，核桃Jr SnRK基因中的顺式作用元件脱落酸响应元件(abscisic acid-responsive element,ABRE)占比最高，为50.3%; 40个Jr SnRK基因家族成员在15条染色体上形成26对共线性关系;在脱落酸、盐胁迫和干旱处理后，Jr SnRK2.2、Jr SnRK3.13与Jr SnRK3.19等基因稳定高表达，表明它们在核桃逆境响应中具有重要调控作用，可作为抗逆分子育种中的关键候选基因。