基于转录组探讨阿尔卑斯浴者菌临床分离株X117自聚集现象与致病性的关联

摘要

阿尔卑斯浴者菌(Balneatrix alpaca)是国内近年从温泉中发现的机会致病菌，已被报道可引起重症肺炎等感染病例。本研究旨在对海南脓毒症患者血液中分离的阿尔卑斯浴者菌X117菌株进行体外培养与转录组分析，以揭示其生长过程中的关键毒力因子及信号通路变化。形态学观察显示，该菌在培养8 h时产生细胞外囊泡，至24 h时呈现自聚集现象并形成由胞外多聚物构成的纤维网络，提示其具备形成生物被膜的能力。利用转录组测序技术(transcriptome sequencing,RNA-seq)分析其基因表达谱的动态变化，结果显示，与生长期组(M8)相比，稳定期组(M24)共有329个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)，包括113个上调DEGs和216个下调DEGs。根据COG功能分析，DEGs主要富集在翻译、细胞壁/膜/包膜生物发生、信号转导机制、转录、细胞运动性及核糖体结构与生物发生等功能类别。KEGG富集分析发现DEGs主要在核糖体、鞭毛组件、细菌趋化性及生物膜形成等通路上富集。进一步通过DEGs注释结果筛选出7个毒力相关基因和3个核糖体功能相关基因进行实时定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)验证，其中Bgc、Pil Z、Osm C、ABC、Rps G和Rpl L的表达趋势与转录组测序结果相一致。本研究揭示了阿尔卑斯浴者菌在不同生长阶段具有不同的致病策略，为理解其感染机制及制定海南温泉相关感染防控措施提供了理论依据。

关键词

温泉 / 阿尔卑斯浴者菌X117 / 差异表达基因(DEGs) / 转录组测序(RNA-seq)