多种癌症与重症肌无力的共享遗传基础:整合多种基因组分析方法的研究

摘要

本研究旨在利用大规模遗传数据探索多种癌症与重症肌无力(myasthenia gravis,MG)的共同遗传基础。通过整合9种癌症和MG及其两种亚型的全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)数据，采用连锁不平衡评分回归(linkage disequilibrium score regression,LDSC)、复合零假设下的多效性分析(pleiotropic analysis under composite null hypothesis,PLACO)和孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法进行分析。结果发现，六对癌症-MG性状间存在显著遗传相关性，尤以肾癌(kidney cancer,KC)为著。共识别出162个多效性单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)，对应30个独立风险基因座，功能富集分析提示，这些基因在淋巴组织中特异性表达。MR分析揭示，早发型MG(early-onset MG,EOMG)与肾癌风险负相关，而晚发型MG(late-onset MG,LOMG)与乳腺癌(breast cancer,BC)风险正相关。癌症与MG存在共享的遗传结构，为理解其共同机制和开发靶向策略提供了新见解。

关键词

癌症 / 重症肌无力 / 遗传相关性 / 多效性基因 / 孟德尔随机化