肝癌细胞衰老基因特征模型的构建以及预后分析

宋德静; 张腾飞; 庄星星

doi:10.13417/j.gab.045.000709

基因组学与应用生物学 ›› 2026, Vol. 45 ›› Issue (3) : 709 -721. DOI: 10.13417/j.gab.045.000709

肝癌细胞衰老基因特征模型的构建以及预后分析

宋德静, 张腾飞, 庄星星

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摘要

本研究旨在构建肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)细胞衰老基因特征模型并对其进行预后分析。从基因表达综合数据库(gene expression omnibus, GEO)(GSE14520)和癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)数据库筛选HCC中差异表达的细胞衰老相关基因(differentially expressed aging-related genes, DEARGs)。根据DEARGs将HCC患者分为两种不同的亚型,并评估队列中每个细胞衰老相关基因的预后价值,构建细胞衰老多基因特征模型来预测HCC患者的生存期。研究共筛选了HCC中21个DEARGs,使用最小绝对收缩与选择算子(least absolute shrinkage and selection operator, LASSO)Cox回归分析筛选出了4个核心DEARGs,即CDK1、 RHEB、 SERPINE1和GADD45A。GEO队列中的HCC患者被成功分为低风险组和高风险组。低风险患者的生存率显著高于高风险患者(P<0.000 1)。此外,使用风险评分值将独立GEO队列中的HCC患者分为两个风险亚组。低风险患者的总生存期较高(P<0.000 1)。整合HCC患者的风险评分值和临床特征,计算风险评分的独立生存预测值。本研究成功建立了HCC细胞衰老基因特征模型,对HCC的临床治疗和预后分析具有一定的应用价值。