叶瘤病菌全基因组测序及其致病相关基因分析

李美霞; 陈亚丽; 钱新; 刘伟中; 付佑胜; 陈香华; 周长勇

doi:10.13417/j.gab.045.001011

基因组学与应用生物学 ›› 2026, Vol. 45 ›› Issue (4) : 1011 -1021. DOI: 10.13417/j.gab.045.001011

叶瘤病菌全基因组测序及其致病相关基因分析

李美霞, 陈亚丽, 钱新, 刘伟中, 付佑胜, 陈香华, 周长勇

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摘要

叶瘤病菌(Fereydounia khargensis)是引起芡(Euryale ferox)叶瘤病的病原之一,本研究以该病原菌菌株QB24为研究对象,利用PacBio三代测序技术完成其全基因组测序,并系统开展了基因组结构、功能注释及次级代谢潜能分析。基因组特征显示,该基因组大小为23.7 Mb, G+C含量为59.93%,预测的编码基因有5 572个,编码区覆盖率为38.71%。通过KOG、 CAZy、 PHI数据库分别注释到1 819、 326、 803个基因,其中包括225个细胞壁降解酶相关基因。研究发现2个致病效应因子与玉米瘤黑粉菌(Ustilago maydis)毒力效应蛋白基因erc1高度同源, 7个导致致病性丧失的基因在玉米瘤黑粉菌中保守存在。次级代谢产物分析预测到10个基因簇,包含3个非核糖体肽合成酶(nonribosomal peptide synthetase, NRPS)基因簇。MAPK信号通路分析鉴定出Fus3、 Hog1及Kss1三条核心通路,提示其可能协同调控病菌发育、代谢、胁迫耐受和致病力。这些结果为进一步解析叶瘤病菌的致病机制提供了基因组学基础。