基于网络药理学和分子对接探讨莪术醇治疗肝癌的作用机制

摘要

目的 利用网络药理学和分子对接方法探讨莪术醇治疗肝癌的分子机制。方法 检索中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）、Swiss Target Predition和PharmMapper数据库获取莪术醇的相关靶点，采用UniProt数据库对基因名称进行校正；在GeneCards、Online Mendelian Inheritance in Man(OMIM)、Therapeutic Target Database(TTD)数据库中检索肝癌疾病的相关靶点；利用Venny 2.1.0在线软件获取药物与疾病的共有靶点；STRING数据库构建蛋白相互作用网络；DAVID数据库对靶点进行基因本体论功能富集和京都基因和基因组数据库通路富集分析；利用Cytoscape 3.8.2软件绘制药物-靶点-通路-疾病网络；使用Kaplan Meier-Plotter数据库分析核心靶点基因的表达与肝癌生存期的相关性，借助AutoDock软件对莪术醇和关键靶点进行分子对接验证。结果 莪术醇可以调控92个靶点和87条通路，通过白蛋白（ALB）、表皮生长因子受体（EGFR）、胰岛素样生长因子1(IGF1)、类固醇受体辅助活化因子（SRC）、雌激素受体α(ESR1)、热休克蛋白αA1(HSP90AA1)、胱天蛋白酶-3(CASP3)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、B细胞淋巴瘤因子2样蛋白1(BCL2L1)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)等关键靶点介导癌症通路、癌症中的蛋白多糖、肾素-血管紧张素系统（Ras）、催乳素、磷脂酰肌醇-3-激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶（PI3K-Akt）、叉头框蛋白O类（FoxO）等信号通路对肝癌发挥治疗作用。生存期分析结果显示，ALB、EGFR、IGF1、ESR1、SRC、HSP90AA1、PPARG基因的表达量与肝癌患者的生存期均具有相关性。分子对接结果表明筛选的靶点蛋白与莪术醇具有较好的结合活性。结论 莪术醇可以通过多靶点、多途径发挥治疗肝癌的作用。

关键词

莪术醇 / 肝癌 / 网络药理学 / 分子对接 / 作用机制