一年生辣椒CaMYB44基因功能的初步解析

摘要

MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)转录因子家族在植物应对环境胁迫中发挥重要作用。一年生辣椒（Capsicum annuum）是辣椒属种植范围最广的一个栽培种。通过分析前期研究得到的转录组数据，聚焦CaMYB44转录因子，并对其基因启动子顺式作用元件、蛋白结构、进化关系、亚细胞定位以及低温响应等进行生物信息学分析与初步实验验证。CaMYB44基因开放阅读框（Open Reading Frame,ORF）长度为981 bp，编码氨基酸为326 aa，不稳定的亲水性蛋白。经预测，CaMYB44蛋白上无信号肽以及跨膜结构域为非分泌蛋白，属于R2R3型MYB。系统发育树分析结果显示，CaMYB44基因与SmMYB73、NtMYB44-like、StMYB44-like和SlMYB44同源性较高，其次为AtMYB70、OsMYB77。顺式作用元件分析结果显示，CaMYB44基因启动子区包含1个低温响应元件以及多个脱落酸和光响应元件。亚细胞定位结果表明CaMYB44定位于细胞核。实时荧光定量反转录·聚合酶链反应（real time fluorescent quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-qPCR）结果显示，CaMYB44的表达量在4℃低温胁迫24 h后下调，与其他低温胁迫负调控因子在处理下的表达趋势相似。研究结果为进一步解析一年生辣椒中耐低温胁迫转录因子提供了基础数据。

关键词

一年生辣椒 / CaMYB44 / 基因克隆 / 表达分析