番茄不同组织及不同激素处理下内参基因的筛选

摘要

番茄（Solanum lycopersicum）是遗传学和分子生物学的研究模型。近年来，番茄内参基因的筛选已有较多的研究报道，但关于外源植物激素处理的种类较少，因此，本研究尝试筛选番茄在不同外源植物激素处理和不同组织部位中稳定表达的内参基因。为筛选番茄不同组织部位及植物激素处理下稳定表达的内参基因，以DANJ、EF-1α、ACT、UBI、APT、CAC、TIP41和RPL8作为候选内参基因，在生长素、赤霉素、脱落酸、细胞分裂素、水杨酸、油菜素内酯、乙烯和不同组织部位8种试验条件下，利用geNorm、NormFinder、BestKeeper、Delta CT和RefFinder等算法对候选内参基因的稳定性进行综合评估，并通过生长素响应基因SlGH3.4对内参基因的稳定性进行验证。结果显示，APT是生长素、赤霉素、脱落酸、油菜素内酯处理和不同组织部位中表达最稳定的内参基因，UBI是全部样品中、细胞分裂素和水杨酸处理下最稳定的内参基因；TIP41是乙烯处理下表达最稳定的内参基因。最后，以综合排名较稳定的APT作为内参基因时发现，SlGH3.4基因的表达水平在生长素（IAA）处理条件下显示出相似的趋势，而稳定性较差的RPL8基因未能对目的基因的表达量进行准确校正。该研究结果可为后续番茄响应外源激素处理的基因表达网络分析和分子调控机制研究提供理论支撑。

关键词

番茄 / 激素 / 内参基因 / qRT-PCR / 基因表达分析

基金资助

海南省自然科学基金项目（No.324RC457）; 海南省教育厅研究生创新项目（Nos.Qhys2023-247、Qhys2023-249）