参薯BBR-BPC基因家族的挖掘和特征分析

赵奥特; 林慧婷; 张宇霆; 黄小龙; 吴文墙; 夏薇; 黄东益

doi:10.15886/j.cnki.rdswxb.20250026

热带生物学报 ›› 2026, Vol. 17 ›› Issue (03) : 390 -398. DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.20250026

参薯BBR-BPC基因家族的挖掘和特征分析

赵奥特, 林慧婷, 张宇霆, 黄小龙, 吴文墙, 夏薇, 黄东益

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摘要

为了解参薯(Dioscorea alata)中BBR-BPC基因家族对其生长发育的调控作用，对参薯BBR-BPC基因家族的基因结构、系统进化、保守基序和编码蛋白理化性质进行分析，同时对BBR-BPC蛋白二级、三级结构进行预测，并验证了BBR-BPC基因与DELLA基因之间的互作关系。通过HMMsearch和BLAST分析，共在参薯基因组鉴定了6个BBR-BPC家族成员。这些基因蛋白特性存在差别明显，且存在可变剪切，共检测到10个剪接本。亚细胞定位分析发现，参薯BBR-BPC家族在细胞核内均有定位。Da4BBR-BPC2与参薯DaDELLA2的酵母双杂互作结果表明，Da4BBR-BPC2与DaDELLA2存在互作关系，且发生在DaDELLA2基因的N端。