木薯ERF基因家族Ⅶ亚族的鉴定与表达分析

摘要

为了探究木薯（Manihot esculenta）ERF基因家族Ⅶ亚族在木薯应对生物胁迫中的潜在功能，本研究对该家族进行了全基因组扫描，在木薯基因组中鉴定了161个ERF基因家族成员，将其分为13个亚族。对Ⅶ亚族成员进行保守结构域、启动子顺式作用元件、互作蛋白、靶基因及表达模式分析。结果表明，该亚族成员均含有一个保守的AP2结构域，其启动子区域包含13种与植物生长发育、环境胁迫响应相关的顺式作用元件。表达模式分析发现，MeERF46、MeERF133、MeERF92基因均积极响应Xpm侵染，其中MeERF92表达量变化最显著；WGCNA和蛋白互作网络分析显示MeERF92可能参与了氧化应激过程，而MeERF133广泛参与了糖酵解过程。以上结果为深入研究ERF在木薯应答生物胁迫中的功能和作用机制提供了候选基因。

关键词

木薯 / ERF基因家族 / 生物信息学分析 / 表达分析