放疗抵抗宫颈鳞状细胞癌circRNAs表达谱的初步研究

摘要

目的 ：分析放疗敏感及放疗抵抗宫颈鳞状细胞癌(cervical squamous cell carcinoma, CSCC)患者肿瘤组织中差异表达环状RNA(circular RNAs, circRNAs)。方法：采用Illumina PE150高通量测序技术法检测3例放疗抵抗及3例放疗敏感CSCC患者肿瘤组织中差异表达circRNAs，对测序获得的序列进行信息挖掘及分析。利用逆转录定量聚合酶链式反应(quantitative real time-polymerase chain reaction, qRT-PCR)法对测序获得的60个差异显著circRNAs进行验证。结果：放疗敏感与放疗抵抗CSCC组织间差异表达在2倍及以上共有1 316个circRNAs。与放疗敏感CSCC相比，放疗抵抗CSCC组织中显著上调的circRNAs共594个，显著下调的circRNAs共722个。对差异circRNAs来源基因进行基因本体(Gene Ontology, GO)分析发现：就细胞生物学过程而言，差异circRNAs主要富集于细胞代谢过程、细胞器组织、初级代谢过程、杂环代谢过程等；就分子功能而言，差异circRNAs主要富集于蛋白质结合、激酶结合、染色质结合、杂环化合物结合等。京都基因和基因组大百科全书数据库(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)信号通路富集分析发现，差异circRNAs富集于甲状腺激素信号通路、Hippo信号通路、FoxO信号通路等通路。qRT-PCR分析证实，与放疗敏感CSCC相比，hsa＿circ＿0003373、hsa＿circ＿0004337、hsa＿circ＿0005114、hsa＿circ＿0031431、novel＿circ＿0006491、novel＿circ＿0070688、novel＿circ＿0070695在放疗抵抗CSCC组织中显著下调(均P<0.05)。结论：与放疗敏感CSCC相比，hsa＿circ＿0003373、 hsa＿circ＿0004337、 hsa＿circ＿0005114、 hsa＿circ＿0031431、 novel＿circ＿0006491、 novel＿circ＿0070688、 novel＿circ＿0070695在放疗抵抗CSCC组织中显著下调，为进一步研究circRNAs在CSCC放疗抵抗中的作用提供实验数据。

关键词

宫颈鳞状细胞癌 / 放疗抵抗 / 环状核糖核酸