SCCNM网络分析方法及其在阿尔兹海默病机理研究中的应用

摘要

本文基于单细胞数据构建了生物在两种状态下的网络结构差异性分析方法，称为SCCNM,这种方法具有一定的普适性.采用SCCNM对阿尔兹海默病小鼠单细胞数据(GSE140399)进行研究，分别构建了皮层中Neu＿5、 Ast、 Neu＿6、 Oli、 Endo、 Microglia和海马中Neu＿5、 Ast、 Oli、 Endo的单细胞通讯网络.相对于健康状态，阿尔兹海默病状态下皮层增加了Ast、 Oli和Mic之间的相互通讯，海马增加了Ast与Endo、 Oli、 Neu＿5的通讯，特别是海马区Ast的基因关联网络发生了显著变化，它的结构参数差异基因的主要富集功能是氧化磷酸化(mmu00190)、翻译后蛋白磷酸化(R-MMU-8957275)和对金离子的反应(GO:0010038).这些结果为研究阿尔兹海默病提供了生物信息学依据.

关键词

阿尔兹海默病(AD) / 单细胞通讯网络 / 结构参数差异基因(SDEGs)

基金资助

山东科技大学“群星计划”（QX2025Z16）