基于整合分析基因表达数据筛选急性胰腺炎中差异表达基因

摘要

目的 了解急性胰腺炎（acute pancreatitis,AP）的生物学和分子发病机制，为预防和治疗AP提供依据。方法 从基因表达总库数据库获取基因表达数据集GSE109227、GSE3644和GSE65146，其中包括AP小鼠和对照小鼠胰腺样本的基因表达谱。使用GEO2R鉴定所有差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs），并使用基因本体（gene ontology,GO）和京都基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）富集分析进行注释。结果 在GSE109227、GSE3644和GSE65146数据集中发现38个共同的DEGs，将其构建成1个蛋白质-蛋白质相互作用（protein-proteininteraction,PPI）网络，确定了枢纽蛋白，并提取了功能模块。通过PPI网络分析确定参与粘连接头通路的3个基因（Cdh1、Iqgap1和Actn4），可能为AP的诊断和治疗提供潜在的生物标志物。结论 Cdh1、Iqgap1和Actn4基因对AP的发生和发展有影响，这可能为AP的诊断和治疗提供新的靶点。

关键词

急性胰腺炎 / 差异表达基因 / GO和KEGG分析 / 蛋白质-蛋白质相互作用 / 生物标志物