口腔鳞状细胞癌中铜死亡基因的表达及其临床意义

摘要

目的 探讨铜死亡相关基因（CRGs）在口腔鳞状细胞癌（OSCC）中的表达特征，以及与免疫浸润、患者预后的关系。方法 由GeneCards数据库获得CRGs列表，从TCGA下载的RNAseq数据经TPM标准化，剔除非口腔癌样本后保留362例（含32例癌旁组织）。通过limma包筛选差异基因，分析基因相关性，使用clusterProfiler包进行GO/KEGG富集分析。构建DEGs蛋白互作网络、基因互作网络。Cox分析筛选与预后相关的DEGs，构建临床信息列线图，GSVA包分析预后分子和免疫浸润关系，以及预后分子的m6A甲基化分析。结果 共获得31个CRGs和20个DEGs。ARID1A与ATP7A、SLC30A7相关性最高（r=0.628、0.630,P<0.001）。GO和KEGG分析显示，DEGs涉及重要的生物过程，如对脂多糖反应、细胞衰老等。蛋白互作网络分析显示CALCOCO2、TAX1BP1、SQSTM1等为关键枢纽基因。RUNX1、NFE2等是多个DEGs的共同转录因子。HSPD1(HR=1.402,P=0.004)、SQSTM1(HR=1.389,P=0.046)和CALCOCO2(HR=1.323,P=0.009)高表达显著降低患者生存率。外部数据集（GSE85195、GSE30784）和HPA组织染色进一步验证预后分子在OSCC中的高表达。列线图校准结果（C指数=0.694）显示模型的预测性能较好。免疫浸润：HSPD1与肥大细胞丰度呈负相关（r=-0.411, P<0.001）,SQSTM1与自然杀伤细胞（r=0.410, P<0.001）、CALCOCO2与辅助性T细胞（r=0.491, P<0.001）呈正相关，但效应量较弱；m6A甲基化：HSPD1与HNRNPC(r=0.643, P<0.001)、CALCOCO2与YTHDC2(r=0.505, P<0.001)表达呈正相关。结论 HSPD1、SQSTM和CALCOCO2是关键的预后分子，且和免疫细胞浸润、m6A甲基化基因具有相关性。CRGs可能作为OSCC患者潜在的预后因子和治疗靶点，为OSCC的治疗提供新的思路和策略。

关键词

口腔鳞状细胞癌 / 铜死亡 / 预后模型 / 免疫浸润 / 生物信息学分析