基于生信、分子对接和分子动力学分析附子-酸枣仁配伍治疗胃癌的作用机制

摘要

目的 基于生物信息学、网络药理学、分子对接及分子动力学模拟，探究附子-酸枣仁配伍治疗胃癌的潜在分子机制。方法 整合基因表达综合数据库（GEO）与癌症基因组图谱（TCGA）胃癌数据集，利用差异表达分析与加权基因共表达网络分析筛选枢纽（Hub）基因；自TCMSP数据库获取中药活性成分并预测靶点；结合疾病靶点数据库进行交集分析，获得潜在作用靶点并进行富集分析；构建“成分-靶点-通路”网络筛选核心成分；采用分子对接与100 ns分子动力学模拟评估结合模式与稳定性。结果 共筛选出3个关键潜在靶点（ABCG2、MMP7、CCKBR）及245个中药-胃癌交叉靶点，主要富集于PI3K/AKT信号通路、FoxO信号通路等。确定去氧穿心莲内酯、德尔妥因、飞燕草苷和酸枣仁皂苷A为前4位核心活性成分。分子对接显示酸枣仁皂苷A与各靶点结合能均低于-7 kcal·mol^-1，亲和力最强。分子动力学模拟进一步证实，酸枣仁皂苷A与ABCG2的结合自由能为-62.76 kcal·mol^-1，体系稳定。结论 附子-酸枣仁配伍可能通过酸枣仁皂苷A、去氧穿心莲内酯和德尔妥因3种活性成分作用于ABCG2、MMP7、CCKBR等关键靶点，调节PI3K/AKT信号通路、FoxO信号通路等通路，对胃癌肿瘤干细胞、胃癌侵袭转移、不良预后和化疗耐药等产生影响，从而发挥对胃癌的治疗作用。

关键词

附子-酸枣仁配伍 / 胃癌 / 生物信息学 / 网络药理学 / 分子对接 / 分子动力学模拟