基于免疫相关特征的三阴性乳腺癌预后生物标志物的价值分析

摘要

目的 探讨免疫和基质细胞相关基因对三阴性乳腺癌（triple-negative breast cancer, TNBC）预后的影响。方法 利用ESTIMATE算法计算GEO数据库中TNBC样本的免疫评分，使用R包中的limma包筛选差异表达基因。GEO数据库和KM-plotter网站进行生存分析，寻找与TNBC无病生存期显著相关的基因。通过免疫组织化学染色和RT-qPCR验证其中部分基因的表达水平。结果 功能富集和蛋白-蛋白相互作用网络分析显示这些基因主要参与免疫应答。R包中survival包生存分析显示，36个基因中有14个基因与TNBC的DFS显著相关。Cox-LASSO分析筛选出4个与TNBC预后相关的基因。时间依赖的受试者工作特征分析显示，1年生存率的曲线下面积(area under the curve, AUC)为0.95，表明4个基因具有很好的预后预测能力。结论 含杆状病毒IAP重复3 (baculoviral IAP repeat containing 3, BIRC3)基因、CD8抗原(CD8 antigen, CD8A)基因、颗粒溶素(granulysin, GNLY)基因和含三方基序22(tripartite motif containing 22, TRIM22)基因这4个基因可能与TNBC的免疫微环境相关，是TNBC潜在的预后和治疗标志物。

关键词

三阴性乳腺癌 / 肿瘤微环境 / 免疫评分 / 无病生存期