利用公共数据库数据开拓KIAA1324在胰腺癌机制研究中的潜在研究思路

摘要

目的 利用公共数据库资源，对KIAA1324基因在胰腺癌中相关生物信息学进行分析，为胰腺癌相关的机制研究提供思路，拓展研究切入点。方法 利用在线数据库[如UCSC Xena-TCGA Pan-Cancer(PANCAN)数据库、MsigDB数据库]，使用R语言包行KIAA1324泛癌分析、临床相关性分析、自噬基因相关性分析、免疫浸润分析、单基因GSEA；收集我院经病理确诊的胰腺导管腺癌患者的手术切除标本，行实时荧光定量PCR(polymerase chain reaction,PCR)，验证KIAA1324在癌及癌旁组织的差异性表达。结果 泛癌分析显示，KIAA1324与间皮瘤（MESO）、食管癌（ESCA）、肾透明细胞癌（KIRC）、胰腺癌（PAAD）、胸腺瘤（THYM）等多种恶性肿瘤的生存具有相关性，在胰腺癌中其表达情况与生存呈正相关；临床相关性分析，KIAA1324在胰腺癌组织中低表达，在正常胰腺组织相对高表达，差异有统计学意义（P<0.05）；在KIAA1324高低表达组间，生存期、癌组织分级、肿瘤分期差异有统计学意义（P<0.05）；自噬基因相关性分析，筛选出5个与KIAA1324强相关的自噬基因，其中与RAB39B、MAPK10、ATG2B呈正相关，与BCL2L1、RRAS呈负相关；免疫浸润分析，在KIAA1324高低表达组间，有5种存在差异的浸润免疫相关细胞，其中与Bcellsnaive 、Monocytes、Mast cellsresting呈正相关，与T cellsregulatory(Tregs)、MacrophagesM0呈负相关；GSEA富集分析显示，KIAA1324及其相关的自噬基因与多条信号通路有关；临床标本验证了KIAA1324在胰腺癌癌组织中显著低表达，与数据库分析结果相一致。结论 KIAA1324在胰腺癌中低表达，其表达水平可能对生存预后、自噬、肿瘤免疫相关及多种信号通路产生影响，为胰腺癌的机制研究提供丰富的思路。

关键词

KIAA1324 / 胰腺癌 / 生物信息分析

基金资助

北京大学肿瘤医院内蒙古医院“青苗”人才计划(消化道肿瘤重点专科)(QM202311)