牛乳外泌体bta-miR-19b、bta-miR-186调控免疫反应的生物信息学研究

摘要

目的 本研究前期完成了牛初乳和常乳外泌体mi RNA的测序，发现bta-mi R-19b和bta-miR-186差异表达，且是值最小的两个mi RNA。本文旨在探讨这两个外泌体miRNA在牛初乳行使免疫功能发挥作用的分子机理。方法 首先对bta-miR-19b和bta-miR-186在牛初乳和常乳外泌体中表达量的变化进行了分析；然后通过生物信息学方法预测bta-miR-19b和bta-miR-186的共同靶基因，并对靶基因进行功能分析；最后，构建mi RNA-mRNA-KEGG调控互作网络。结果 发现bta-miR-19b在初乳外泌体中的表达量显著高于常乳外泌体，呈现下调表达趋势，bta-miR-186呈现上调表达趋势。这两个mi RNA拥有共同靶基因84个，可能通过GO term中的关键基因MACIR及调控网络中的C3AR、NME7、ENTPD3、PTGFR、RAPGEF4、RICTOR、CLIP1、RRAGD、BOLA-DOA、LCLAT1和DGKK介导牛初乳免疫调控过程。结论 牛初乳外泌体bta-miR-19b和bta-miR-186可能通过调控关键基因MACIR、C3AR和NME7等调控免疫过程。

关键词

牛乳外泌体 / bta-miR-19b / bta-miR-186 / 免疫调控