基于高通量测序技术的microRNA分析在HFpEF患者差异表达谱的相关研究

摘要

目的 通过分析射血分数保留型心力衰竭（heart failure with preserved ejection fraction,HFpEF）患者与健康人外周循环血中差异表达的miRNA，探讨与HFpEF相关的miRNA并对其靶基因进行预测及通路富集分析，筛选出具有诊断HFpEF潜力的miRNA。方法 选取2020年1月至2022年12月在内蒙古医科大学附属医院住院的10名HFpEF患者及同时期在体检中心进行体检的5名健康对照者构建small RNA高通量文库，分析HFpEF患者与健康对照者差异表达的miRNA(DEMs)，通过miRBase数据库对DEMs进行靶基因预测，利用人类基因数据库（genecards）和在线人类遗传孟德尔数据库（online mendelian inheritance in man,OMIM）进行比对获得HFpEF相关基因，与预测靶基因进行关联后取得核心靶基因。利用基因本体（GO）数据库及Matesacpe数据库对核心靶基因进行KEGG富集分析并注释，利用R语言绘制呈现调控HFpEF相关的miRNA-mRNA互作图,初步分析靶基因的功能。结果 small RNA测序分析筛选共获得43个DEMs，其中4个在HFpEF组上调表达，39个下调表达；预测得到15 034个靶基因，与HFp EF相关的核心靶基因有30个，对应的核心DEMs共41个；对30个核心靶基因进行KEGG通路富集分析发现，生热作用、戊糖磷酸途径、JAK-STAT信号通路与HFpEF发生有关，参与的基因有mTOR、H6PD、PIK3CD、PTAFR相关的miRNA为has-miR-3130-3p，下调的has-miR-190-5p、has-miR-144-3p分别与基因PRDM16及基因mTOR存在相关性。结论 HFpEF患者与健康人外周循环血游离miRNA存在表达差异，这些差异表达的miRNA可能与生热作用、戊醣酸途径、JAK-STAT信号通路相关。

关键词

射血分数保留性心力衰竭 / 差异性miRNA / 生物信息学分析 / 信号通路

基金资助

内蒙古自治区高等学校科学技术研究项目（NJZY22664）; 内蒙古医科大学科技百万工程联合项目[YKD2020KJBW(LH)015]