肾透明细胞癌线粒体相关lncRNA预后模型的建立

摘要

目的：近年来对肾透明细胞癌(clear cell carcinoma of kidney,KIRC)的研究进展显著，但该疾病的预后较差，特别是在肿瘤转移的情况下。因此，寻找有效的预后指标和治疗靶点对提高KIRC患者的生存率和生活质量至关重要。本研究旨在探讨线粒体相关长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在KIRC中的预后作用，并建立一个预后模型。方法：从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中获取KIRC的RNA测序和临床数据，并从MitoCarta3.0数据库中提取线粒体基因列表。计算每个lncRNA与线粒体基因的相关系数，并筛选出显著相关的lncRNA。采用R软件的Cox回归分析结合Kaplan-Meier法筛选与KIRC预后相关的lncRNA。构建预后模型，根据模型计算每个样本的风险评分，并根据评分将其分为高风险组和低风险组，进而比较2组的生存期，利用受试者操作特征(receiver operator characteristic,ROC)曲线评估模型的预测能力，再使用Cox回归分析风险评分与患者临床特征的相关性。结果：相关系数筛选出31个与KIRC线粒体相关的lncRNA。Cox回归分析和Kaplan-Meier法筛选确定了6个与KIRC预后高度相关的lncRNA，并构建了其预后模型。该模型的ROC曲线下面积为0.723，表明该模型具有良好的预测能力。另外，风险评分与患者年龄、肿瘤分级、病理分期及T分期呈正相关，多因素Cox分析结果显示风险评分为KIRC的独立预后预测因子。结论：本研究建立的基于线粒体相关lncRNA的预后模型为KIRC患者提供了一个预后评估工具，这将有助于指导KIRC的个体化治疗和预后评估。

关键词

肾透明细胞癌 / 线粒体 / 长非编码RNA / 预后 / 模型

基金资助

湖南省自然科学基金(2021JJ41094)