2015至2025年某县级三甲医院碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的分子流行病学研究

摘要

目的：碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)在全球传播和流行，成为抗感染领域的重要挑战，尤其是高毒力碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(hypervirulent carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,HCKP)的出现，增加了感染控制难度。本研究通过监测本地区CRKP的分子流行病学特征，了解高毒力高耐药菌株流行情况，旨在为CRKP治疗措施及防控策略的制定提供科学依据。方法：对2015年1月至2025年2月滕州市中心人民医院复苏成功的66株CRKP进行药敏试验、碳青霉烯酶表型测试和全基因组测序，并分析其耐药基因、毒力基因、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、荚膜血清分型及构建系统发育树。结果：CRKP主要分布于重症监护病房、神经外科、新生儿科，药敏试验结果显示其对β-内酰胺类药物、喹诺酮类、氨基糖苷类耐药率高，分别为≥97.0%、87.9%和59.1%；对头孢他啶阿维巴坦、替加环素和多黏菌素B耐药率低，分别为19.7%、3.0%和4.5%。MLST有15个克隆，优势克隆为序列型(sequence type,ST)11、ST15、ST45、ST147和ST2237。根据MLST结果将菌株分为ST11组和非ST11组。ST11组CRKP对阿米卡星、左氧氟沙星耐药率均高于非ST11组，而对复方新诺明、头孢他啶阿维巴坦耐药率均低于非ST11组，差异均有统计学意义(均P<0.05)。CRKP主要产碳青霉烯酶为2型肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶(Klebsiella pneumoniae carbapenemase-2,KPC-2)(50/66)和新德里金属-β-内酰胺酶(New Delhi metallo-β-lactamase,NDM)-1/3/5/13(14/66)；高毒力菌株13株，K血清分型为K1(1株)、K2(1株)和K64(11株)。K64(31/66)与K47(11/66)为主要血清型，其次为K25(7/66)和K19(5/66)。系统发育树构建发现多个克隆出现院内传播，在新生儿科有6株ST11-K47 CRKP疑似暴发。结论：ST11-K64为本地优势克隆，并出现高毒力高耐药株，应成为感染控制和临床研究的重点；新生儿科出现ST11-K47 CRKP的疑似暴发且碳青霉烯酶型逐渐改变，提示持续动态监测其分子流行病学的重要性。

关键词

碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌 / 全基因组测序 / 耐药基因 / 毒力基因 / 多位点序列分型 / 荚膜血清型 / 分子流行病学