基于网络药理学及生信分析探究委陵菜治疗胃癌的潜在机理

摘要

目的 利用网络药理学和生信分析来探究委陵菜治疗胃癌的有效机理。方法 采用的数据库信息网络平台属于中药系统药理学的范围(the traditional Chinese medicine database analysis platform, TCMSP),并在其中建立了特殊的筛查标准，以确保委陵菜中所含有的有效成分被准确检测出来。经过研究发现委陵菜的主要活性成分的靶点可以在多个数据集中得到，包括Swiss、SEA、TCMSP、PharmMapper等。从GEO(取3个GSE文件)数据库获取胃癌的主要作用靶点，将以上4个数据库预测的药物靶点与3个GSE数据集预测的胃癌靶点取交集得到委陵菜与胃癌的共同靶点；通过STRING数据库对两者的共同靶点进行蛋白互作(protein-protein interaction network, PPI)网络分析搭建了PPI模型，探索委陵菜和胃癌之间的关联性。通过Metascape平台对委陵菜与胃癌的共同靶点进行GO与KEGG富集分析，同时采用微生信在线生物信息学分析、可视化云平台进行可视化分析。结果 利用TCMSP平台筛选得委陵菜6种有效活性成分及748个作用靶点，3个GSE数据集得到胃癌靶点833个，取交集得到委陵菜与胃癌的49个共同靶点；委陵菜治疗胃癌的有效活性成分分别为丁子香萜、鞣花酸、异鼠李素、槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等；对应的靶点分别为CXCL8、SERPINE1、SPP1、CYP2C19、GSTA1等；主要通过PI3K-Akt、MAPK、P53等信号通路发挥作用。结论 委陵菜治疗胃癌的特点主要有成分复杂、靶点丰富、通路繁多，结合网络药理学理论，再通过生信分析预测到委陵菜可能通过PI3K-Akt、MAPK、P53等相关通路能够产生治疗胃癌的效果，从理论层面为胃癌的相关探索提供参考。

关键词

委陵菜 / 网络药理学 / 胃癌 / 中西医结合