滑膜肉瘤核心基因的鉴别

摘要

目的分析无转移和转移滑膜肉瘤的基因芯片,筛选与滑膜肉瘤转移和预后相关的核心基因。方法下载mRNA表达谱数据库GSE40025/GPL6480芯片数据集,对基因芯片中的无转移和转移滑膜肉瘤样本进行差异表达基因(DEGs)筛选。对DEGs进行GO功能注释和KEGG富集分析,构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI),分析与滑膜肉瘤转移和预后相关的核心基因和关键信号通路。最后,使用TCGA数据库分析核心基因的表达对生存预后的影响。结果 CDK1、IL-6、KIF11、KIF20A、CCNA2、AURKA、CENPE、KIF4A和CCNB2是最有可能参与滑膜肉瘤转移并与生存率相关的核心基因。细胞黏附分子、细胞因子-细胞因子受体相互作用、PI3K-AKT信号通路与Th17型细胞分化可能是参与滑膜肉瘤转移的关键信号通路。结论本研究鉴定出与滑膜肉瘤转移密切相关的核心基因,为滑膜肉瘤的治疗和预后提供更多有效的靶点。

关键词

滑膜肉瘤 / 转移 / 预后 / 基因芯片