基于mRNA组学构建弥漫大B细胞淋巴瘤预后模型

摘要

目的 根据mRNA组学数据筛选弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)预后相关基因并建立预后模型。方法 从TCGA数据库下载NCICCR-DLBCL数据集中234例DLBCL患者mRNA组学数据和预后数据作为训练集，从GEO数据库下载GSE87371数据集中223例DLBCL患者相应数据作为验证集，通过Cox回归分析、Kaplan-Meier分析和LASSO分析建立预后模型，结合生存曲线和ROC曲线验证模型的准确性。采用免疫组化法验证117例DLBCL组织中CD70蛋白的表达及其与预后的关系。结果 构建包含14个独立预后预测mRNA(ANO3、ZNF93、RAD9B、PROC、ZSCAN20、RBBP9、SLC18B1、CXorf21、MUC12、CYP2U1、VSIG4、CCDC178、CD70、GHRH)的预后模型。高风险组生存时间显著短于低风险组(P<0.000 1),ROC 1年、3年和5年生存率曲线下面积分别为0.92、0.90和0.91。CD70阳性组与阴性组的Kaplan-Meier生存曲线差异有统计学意义(P=0.009 4),阳性组生存时间较短。结论 成功建立了基于mRNA表达的DLBCL预后预测模型，为mRNA转录组学在DLBCL预后预测中的实际应用提供了可行性方案，并在临床样本中证实CD70高表达与DLBCL预后密切相关，可作为临床预后评价的指标之一。

关键词

mRNA / CD70 / 弥漫大B细胞淋巴瘤 / TCGA数据库 / 预后模型 / 生存分析

基金资助

徐州市科技计划重点研发项目(KC21207)