AcSDKP与TGF-β受体1相互作用的分子对接研究

摘要

目的 利用分子对接方法阐释AcSDKP及其突变体多肽与转化生长因子β(TGF-β)受体1相互作用。方法 利用药物设计平台Sybyl-X2.1构建的AcSDKP及其突变体多肽的分子结构，采用Surflex分子对接方法将AcSDKP及其突变体多肽对接到TGF-β受体1中，考察它们的分子对接打分数值及相应的结合用模式。结果 AcSDKP可与TGF-β受体1形成稳定的相互作用，且以氢键相互作用为主。AcSDKP的第2位氨基酸当突变为色氨酸时(即AcSWKP)具有比原型肽AcSDKP更强的TGF-β受体1结合能力。除了AcSWKP,其他突变体在与TGF-β受体1的相互作用时要弱于AcSDKP。结论 AcSDKP可以与TGF-β受体1形成稳定的相互作用，说明AcSDKP可能是通过抑制TGF-β受体1来发挥其抗纤维化的生物活性。另外，分子对接方法预测AcSDKP的突变多肽AcSWKP可能具有更强的抗纤维化活性。

关键词

AcSDKP / TGF-β受体1 / 分子对接 / 结合模式

基金资助

江苏省自然科学基金青年项目(BK20140225); 徐州市科技项目(KC16SG249); 徐州医科大学优秀人才科研启动基金(D2014008); 江苏省大学生创新创业训练计划项目(201610313014Z); 国家级大学生创新创业训练计划项目(201610313014); 江苏高校品牌专业建设工程资助项目(PPZY2015C224)