健康宠物狗粪便中分离鉴定索氏梭菌1株

摘要

目的对1株菌落形态近似艰难梭菌的未知菌株进行鉴别、系统进化及药敏分析。方法利用艰难梭菌选择性分离培养方法从健康宠物狗粪便中分离纯化菌种。利用艰难梭菌抗原胶乳凝集快速检测试剂盒和艰难梭菌磷酸丙糖异构酶(triose phosphate isomerase,Tpi)编码基因tpi PCR扩增进行生化和分子鉴别。PCR扩增未知菌株的16S rDNA基因、测序进行分子鉴定;利用MEGA 7.0等软件构建系统进化树对其进行系统进化分析,利用琼脂糖稀释法对该菌株进行药物敏感性试验。结果艰难梭菌选择性培养方法获得的菌落形态疑似艰难梭菌的未知菌株经生化以及分子鉴别后并非艰难梭菌。16S rDNA序列比对和系统进化分析表明:该菌株系与艰难梭菌同属的索氏梭菌(Clostridium sordelli),与艰难梭菌有较近的亲缘关系,对氨苄西林、克林霉素以及莫西沙星敏感。结论利用艰难梭菌选择性分离培养方法在健康宠物狗粪便中获得菌落形态与艰难梭菌相似的未知菌株为索氏梭菌,其耐药谱型与艰难梭菌差异较大。

关键词

索氏梭菌 / 艰难梭菌 / 16S rDNA / 系统进化树 / 耐药谱