基于生物信息学辨认阿尔茨海默病关键基因及通路的改变

许灿坤, 刘久煜, 郑英伟, 牛海晨, 杨荣礼

徐州医科大学学报 ›› 2022, Vol. 42 ›› Issue (07) : 484 -490.

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基于生物信息学辨认阿尔茨海默病关键基因及通路的改变

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摘要

目的 使用生物信息学数据处理方法,初步探讨阿尔茨海默病(AD)潜在的分子机制。方法 通过GEO2R筛选GSE5281和GSE132903数据集中的差异表达基因(DEGs),利用Metascape、STRING和Cytoscape软件对DEGs进行系统的生物信息学分析,并通过qPCR方法在AD模型小鼠中对筛选到的关键基因进行验证。结果 在2个数据集中共筛选出250个重叠的DEGs,主要富集于突触传递、神经系统等条目。通过构建蛋白-蛋白作用网络(PPI),筛选关键基因并验证,最终选出4个关键基因,分别为突触相关蛋白25(SNAP25)、突触蛋白Ⅰ(SYN1)、γ-氨基丁酸A型受体γ2亚基(GABRG2)、突触结合蛋白Ⅳ(SYT4)。结论 AD的发病与SNAP25、SYN1、GABRG2、SYT4基因密切相关,主要涉及突触神经递质释放过程。这些发现将有助于深入了解AD发病的分子机制,为未来新药物开发提供潜在的作用靶点,为疾病早期诊断及治疗提供新思路。

关键词

阿尔茨海默病 / 生物信息学 / 差异表达基因 / 化学突触传递 / 关键基因

Key words

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许灿坤, 刘久煜, 郑英伟, 牛海晨, 杨荣礼 基于生物信息学辨认阿尔茨海默病关键基因及通路的改变[J]. 徐州医科大学学报, 2022, 42(07): 484-490 DOI:

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