CNV-seq联合STR分析在产前诊断中的应用

摘要

目的 评估低深度全基因组拷贝数变异测序(CNV-seq)联合短串联重复序列(STR)分析在产前诊断中的应用价值。方法 选取522例有产前诊断指征的孕妇为研究对象，采集羊水标本同步进行CNV-seq测序、STR分型及染色体核型分析，对比CNV-seq联合STR分析与染色体核型分析在染色体异常检出中的效能。结果 CNV-seq联合STR分析总体染色体异常检出率为13.98%(73/522),高于染色体核型分析的染色体异常检出率[9.58%(50/522)],差异有统计学意义(P<0.05)。两种检测策略染色体数目异常与嵌合体检出结果一致，嵌合比例检测结果呈高度正相关(r=0.937 0,P<0.05)。结构异常检测中，CNV-seq联合STR分析检出染色体结构异常胎儿50例，漏检23例染色体多态、倒位及易位；染色体核型分析检出染色体结构异常27例，漏检46例103.98 kb～6.27 Mb微小拷贝数变异(CNVs)。以染色体核型分析为金标准，CNV-seq联合STR分析检测敏感度54.00%,特异度90.25%,阳性预测值36.99%,阴性预测值94.88%,总符合率86.78%。单一指征孕妇中，CNV-seq联合STR分析染色体异常检出率更高，无创产前检测(NIPT)高风险组染色体异常检出率最高。结论 CNV-seq联合STR分析分辨率高、覆盖度广、检测周期短，在微小CNVs检测中表现突出，可作为染色体核型分析的重要补充，二者联合应用可提升产前诊断的全面性与准确性，助力降低出生缺陷。

关键词

拷贝数变异测序 / 短串联重复序列 / 核型分析 / 产前诊断 / 出生缺陷