4种柳属植物叶片差异表达基因分析

杜少波, 姜迪, 鄂崇毅, 谢惠春

高原科学研究 ›› 2025, Vol. 9 ›› Issue (1) : 30 -42.

高原科学研究 ›› 2025, Vol. 9 ›› Issue (1) : 30 -42. DOI: 10.16249/j.cnki.2096-4617.2025.01.004

4种柳属植物叶片差异表达基因分析

    杜少波, 姜迪, 鄂崇毅, 谢惠春
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摘要

为探究腹毛柳(Salix delavayana)、坡柳(Salix myrtillacea)、康定柳(Salix paraplesia)和乌柳(Salix cheilophila)叶片的关键代谢途径和差异表达基因。该研究提取了以上4种柳属植物叶片总RNA后构建cD-NA文库,采用转录组测序技术进行测序,基于NR、GO和KEGG等数据库进行注释和功能富集分析,并探讨4种柳属植物间的差异表达基因和主要代谢途径。结果发现,在4种柳属植物种共检测到245 994个Unigene,NR数据库注释结果表明,与小垫柳(Salix brachista)的同源性最高;GO和KEGG数据库注释结果发现,4种柳属植物主要参与细胞过程、代谢过程、细胞结构体、结合以及与信号转导功能和与代谢相关的功能;腹毛柳与坡柳、康定柳和乌柳的差异基因数量分别为34 436条、49 756条、87 442条,坡柳与康定柳和乌柳的差异基因数量分别为51 686条和89 806条,康定柳和乌柳的差异基因数量为100 423条;差异基因显著富集于植物病原体相互作用、植物昼夜节律、光合作用、蛋白水解、ABC转运蛋白和植物激素信号转导等二级代谢途径。研究结果可为进一步探究柳属植物的适应性机制提供理论参考。

关键词

转录组测序技术 / 柳属植物 / 差异表达基因 / 代谢途径

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杜少波, 姜迪, 鄂崇毅, 谢惠春. 4种柳属植物叶片差异表达基因分析[J]. 高原科学研究, 2025, 9(1): 30-42 DOI:10.16249/j.cnki.2096-4617.2025.01.004

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