基于生物信息学探讨治疗糖尿病和糖尿病肾病的共同靶点及活性化合物

摘要

目的：基于生物信息学探讨治疗糖尿病(DM)和糖尿病肾病(DKD)的共同靶点，并筛选活性化合物。方法：通过GEO数据库获得DM数据集和DKD数据集，并筛选差异表达基因(DEGs)。通过R语言获得DM和DKD的交集基因，并进行基因本体论(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析、免疫浸润分析、加权基因共表达分析(WGCNA)、外部数据集差异表达分析及受试者工作特征(ROC)曲线分析以获得调控DM和DKD的关键靶点，最后进行靶点化合物筛选，并进行分子对接验证。结果：共获得DM和DKD的交集基因108个，他们主要和免疫相关，WGCNA聚焦到其中14个免疫基因，进一步通过差异表达及ROC分析获得3个调节DM和DKD的关键基因，即GALNT1、MARCKS和SLC38A1。通过CTD数据库预测得到关键靶点的化合物为叶酸、槲皮素、香豆素和酚类抗氧化剂等，分子对接证实他们之间具有较好的亲和力。结论：GALNT1、MARCKS和SLC38A1可能是DM和DKD的共同治疗靶点，叶酸、槲皮素、香豆素和酚类抗氧化剂可能是治疗DM和DKD的活性化合物。

关键词

生物信息学 / 糖尿病 / 糖尿病肾病