基于生物信息学分析肺腺癌潜在预后生物标记物HROB

徐凤岐, 江一民, 陈艺, 莫欣悦, 王梅芳, 唐以军

湖北医药学院学报 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (5) : 494 -501.

湖北医药学院学报 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (5) : 494 -501. DOI: 10.13819/j.issn.2096-708X.2024.05.006

基于生物信息学分析肺腺癌潜在预后生物标记物HROB

    徐凤岐, 江一民, 陈艺, 莫欣悦, 王梅芳, 唐以军
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摘要

目的:通过生物信息学方法探讨HROB在肺腺癌(LUAD)中的表达及预后相关性。方法:从TCGA数据库下载LUAD患者的基因表达谱和临床数据,从HPA数据库下载LUAD患者及健康人群免疫组织化学数据,运用R软件分析HROB基因在LUAD和癌旁组织中的表达差异。临床相关性分析揭示HROB与LUAD患者临床病理特征的相关性。Kaplan-Meier生存分析结合ROC曲线评估HROB的诊断价值及预后分析。Cox回归分析寻找LUAD独立预后因素。GO/KEGG及GSEA信号通路富集分析HROB在LUAD中的潜在功能。CIBERSORT评估HROB表达水平与肿瘤浸润性免疫细胞的相关性。结果:HROB在LUAD中的表达高于癌旁正常组织(P<0.05),并与年龄、吸烟情况、初始治疗效果、TNM分期、病理分级、总生存期(OS)、疾病特异性生存期(DSS)和无进展间隔期(PFI)等临床病理特征呈正相关(P<0.05)。生存分析表明HROB低表达的LUAD患者OS、PFI、DSS明显高于高表达患者(P<0.05)。Cox回归分析发现病理分级Ⅲ、Ⅳ级是影响LUAD预后的独立危险因素(P<0.05),HROB高表达尚不能视为独立预后因子(P>0.05)。功能富集分析提示HROB主要参与细胞周期、染色体分离和同源重组等相关通路。在LUAD免疫细胞浸润中,HROB高表达与NK CD56dim细胞、Tgd细胞、Th2细胞呈正相关(P<0.05)。结论:HROB的高表达与LUAD患者的进展、预后和免疫调节密切相关,它可能成为LUAD预测预后的生物标志物和治疗靶点。

关键词

HROB / 肺腺癌 / 生物信息学分析 / 预后

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徐凤岐, 江一民, 陈艺, 莫欣悦, 王梅芳, 唐以军. 基于生物信息学分析肺腺癌潜在预后生物标记物HROB[J]. 湖北医药学院学报, 2024, 43(5): 494-501 DOI:10.13819/j.issn.2096-708X.2024.05.006

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白求恩公益基金项目(BCF-XC-SQ-20221206-05); 湖北省第二届医学领军人才工程基金资助课题

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