铁皮石斛-牻牛儿基-牻牛儿基焦磷酸合成酶基因的生物信息学分析

刘锦璇; 何天鹏; 吴一凡; 汪圣杰; 丁文文; 刘金成

doi:10.13819/j.issn.2096-708X.2025.03.005

湖北医药学院学报 ›› 2025, Vol. 44 ›› Issue (3) : 280 -287. DOI: 10.13819/j.issn.2096-708X.2025.03.005

铁皮石斛-牻牛儿基-牻牛儿基焦磷酸合成酶基因的生物信息学分析

刘锦璇, 何天鹏, 吴一凡, 汪圣杰, 丁文文, 刘金成

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摘要

目的：对铁皮石斛GGPS基因家族进行分析，旨在通过此实验对该基因的编码信息、功能以及同源序列亲缘关系有更深刻的认识。方法：利用生物信息学的分析方法对铁皮石斛GGPS基因家族的三个基因进行了氨基酸理化性质分析、蛋白质二级结构和三级结构预测、氨基酸序列比对以及构建遗传进化树等，全面解析GGPS基因家族成员的生理生化作用。结果：GGPS基因由三个亚基组成，即：DoGGPS、DoGGR和DoGGPPS1,这三条蛋白都是不稳定的，都不含有信号肽位点，DoGGR和DoGGPPS1有糖基化位点，三条蛋白都不具有跨膜结构，二级结构以α螺旋为主。结论：通过对GGPS基因的生信分析，有助于我们后期对其克隆和进行进一步的功能研究。