基于生物信息学的乳腺癌关键基因及靶向中药活性成分筛选

冯协和; 罗嘉琪; 付梦茹; 柯昌虎

doi:10.13819/j.issn.2096-708X.2026.03.010

湖北医药学院学报 ›› 2026, Vol. 45 ›› Issue (3) : 319 -326. DOI: 10.13819/j.issn.2096-708X.2026.03.010

基于生物信息学的乳腺癌关键基因及靶向中药活性成分筛选

冯协和, 罗嘉琪, 付梦茹, 柯昌虎

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摘要

目的:采用生物信息学方法筛选乳腺癌关键基因，并挖掘治疗乳腺癌的靶向中药活性成分。方法:利用GEO数据库检索乳腺癌基因数据集，通过GEO2R分析得出表达差异基因，运用Venny在线平台获取共有的差异基因，借助DAVID数据库进行GO和KEGG分析，使用STRING数据库构建蛋白相互作用网络，使用Cytoscape软件中cyto Hubba插件筛选关键差异基因，运用TIMER数据库进行免疫浸润分析，通过GEPIA数据库进行差异基因mRNA表达分析，使用Kaplan-Meier Plotter在线平台进行生存预后分析，并利用CTD数据库预测治疗乳腺癌的中药活性成分。结果:共筛选出147个差异基因，其中104个基因表达上调，43个基因表达下调，主要涉及AMPK、PI3KAKT、p53、PPAR等信号通路。TOP2A、CDK1、AURKA、ANLN为4个关键基因，其表达与乳腺癌中B淋巴细胞、CD8⁺T淋巴细胞、中性粒细胞、树突状细胞等免疫细胞的浸润存在显著相关性（P<0.05），且在乳腺癌组织中的表达高于正常组织（P<0.01），高表达患者总生存期（OS）更短（P<0.05）。共筛选出柳穿鱼黄素、白藜芦醇、香豆雌酚、姜黄素等21种治疗乳腺癌的中药活性成分。结论:TOP2A、CDK1、AURKA、ANLN可能是乳腺癌发生发展过程中涉及的潜在关键基因，并挖掘出靶向治疗乳腺癌的中药活性成分，可为其分子机制及治疗药物的研究提供依据。