单细胞测序分析食管鳞癌中癌相关成纤维细胞的分子特征

摘要

目的 利用单细胞测序分析食管鳞癌中癌相关成纤维细胞的特征，构建食管鳞癌患者的预后预测模型。方法 合并GSE160269、GSE196756和GSE188900这3个数据集中食管鳞癌的单细胞测序数据，其中包含70个肿瘤样本和8个正常组织。利用Find All Markers函数对所有癌相关成纤维细胞的亚群进行标识，研究其在食管鳞癌中的作用，然后用R Survival包中的coxph函数来构建比例风险回归模型，并通过构建的预后模型来预测食管鳞癌患者的生存率。结果 癌相关成纤维细胞在食管鳞状细胞癌肿瘤样本中的占比相比正常组织中的占比发生明显改变，分为7个亚群，每个亚群具有不同生物学功能。利用癌相关成纤维细胞中与食管鳞癌患者预后相关的风险因子构建的预后预测模型，可以用来区分高风险人群和低风险人群。结论 本研究揭示了食管鳞癌中癌相关成纤维细胞的分子特征，并通过对其特征基因的分析构建了具有良好预测功能的预后模型。

关键词

食管鳞状细胞癌 / 肿瘤微环境 / 癌相关成纤维细胞 / 差异表达基因 / 预后