基于网络药理学及分子对接探索苗药芭蕉根防治2型糖尿病肾病的分子作用机制

摘要

目的 为明确苗药芭蕉根防治2型糖尿病肾病(2型DN)的活性成分、作用靶点及机制，本文采用网络药理学结合分子对接方法进行研究，以期为后续研究提供科学参考。方法 通过中国知网、PubMed等数据库查询芭蕉根中的化合物，使用TCMSP数据库筛选芭蕉根活性成分，通过TCMSP、PharmMapper Server等数据库收集潜在活性成分的靶点，OMIM、GeneCards数据库挖掘2型DN靶点并获取交集靶点；利用STRING数据库构建交集靶点蛋白互作网络。运用Cytoscape 3.10.0软件可视化PPI网络图和构建“成分-靶点-疾病”网络图，利用DAVID数据库对核心靶点进行KEGG信号通路和GO生物过程富集分析，采用AutoDock软件进行分子对接。最后，采用Pymol软件对结果进行可视化。结果 芭蕉根防治2型DN的活性成分为羽扇豆酮、β-谷甾醇等9种活性成分，获得ALB、AKT1等25个核心靶点。GO功能富集分析与细胞生长凋亡过程、氧化应激密切相关，KEGG主要富集在FoxO、HIF-1、MAPK等信号通路。筛选出HIF1A、STAT3、AKT1、EGFR关键靶点，其关键靶点与活性成分的结合能在(-10.5～-4.7)kcal/mol之间，9个活性成分与关键靶点可能通过氢键作用力相结合。结论 芭蕉根防治2型DN具有多成分、多靶点、多途径的作用特点。

关键词

芭蕉根 / 2型DN / 网络药理学 / 分子对接

基金资助

国家自然科学基金(81860722)