基于网络药理学和分子对接技术探讨六君子汤治疗癫痫的作用机制

摘要

目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨六君子汤治疗癫痫的潜在作用机制。方法 通过TCMSP数据库筛选六君子汤的主要活性成分及其对应靶点；联合GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank数据库检索癫痫相关疾病靶点；利用jvenn在线平台获取六君子汤与癫痫的共同靶点；经Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶点网络图；通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络，并筛选核心靶点；采用R语言软件进行基因本体(gene ontology, GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)信号通路富集分析；运用AutoDock Vina及PyMol软件完成主要活性成分与核心靶点的分子对接及可视化验证。结果 共筛选得到128种活性成分及2 934个癫痫相关靶点，确定六君子汤与癫痫的共同靶点104个；PPI网络分析显示，核心靶点有半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(cysteine aspartic acid specific protease 3,CASP3)、AKT丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT serine/threonine kinase 1,AKT1)、细胞肿瘤抗原p53(tumor protein p53,TP53)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor, TNF)等；GO富集分析表明，核心靶点主要参与氧化应激调控、细胞凋亡进程、炎症反应等生物过程；KEGG富集分析显示，主要涉及降钙素受体(calcitonin receptor, CLR)、TNF、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK)、缺氧诱导因子-1(hypoxia-inducible factor 1,HIF-1)等信号通路；分子对接结果证实，六君子汤中主要活性成分与核心靶点具有稳定的结合能力。结论 六君子汤可能通过多活性成分靶向作用于多个核心靶点，调控CLR、TNF、MAPK、HIF-1等信号通路，影响氧化应激、细胞凋亡、炎症反应等生物过程，进而发挥抗癫痫作用。

关键词

六君子汤 / 癫痫 / 作用机制 / 网络药理学 / 分子对接

基金资助

广西壮族自治区中医药管理局自筹经费科研课题(GZZC2020078); 广西中医药适宜技术开发与推广项目(GZSY21-39)