甜瓜锚定蛋白ANK家族基因生物信息学鉴定分析

摘要

ANK(Ankyrin)锚定蛋白家族编码ANK结构域，植物中ANK家族基因参与调控植物对生物与非生物胁迫的响应．基于甜瓜全基因组及转录组测序数据，对甜瓜中ANK家族基因进行鉴定，分析其空间表达模式及胁迫响应表达模式．共鉴定出78个ANK基因，分为11个亚族；系统进化树分析将甜瓜ANK成员分为7大亚簇，种内8对ANK基因存在共线性关系，5个ANK基因与拟南芥、水稻、黄瓜存在种间共线性关系．CmANK家族基因在不同组织差异表达，不同胁迫下表达亦有所不同．CmANK30在非生物和生物胁迫下均呈现明显的上调表达，表明该基因积极参与逆境胁迫响应调控．

关键词

甜瓜 / ANK / 家族基因 / 生物信息学 / 表达分析