基于RNA-Seq技术初步探索顺铂在口腔鳞状细胞癌的相关耐药机制

摘要

目的 探索口腔鳞状细胞癌（简称口腔鳞癌）顺铂化疗耐药的相关基因及信号通路。方法 建立顺铂诱导的口腔鳞癌细胞耐药模型，将顺铂耐药细胞（HN6-R）与非顺铂耐药细胞（HN6-WT＿Control）进行转录组RNA-Seq测序分析，筛选两组中差异表达的基因（DEGs）,利用生物信息学方法分析差异基因及相关信号通路。结果 测序结果显示顺铂耐药细胞与非顺铂耐药细胞有216个基因发生显著变化（log₂Fold Change, log₂FC>1;adjusted P value<0.05）,其中55个基因下调，161个基因上调。对耐药细胞中上调的基因进行了基因富集分析（GSEA）确定了潜在的耐药相关通路，其中包括IL6/JAK2/STAT3信号通路、TNF-α和NF-κB信号通路、低氧通路、干扰素-γ应答和干扰素-α的应答通路等，其中变化最显著的基因为CXCL10、CXCL11、NR4A3和IGFBP3等。结论 IL6/JAK2/STAT3等信号通路在口腔鳞癌顺铂耐药细胞株中显著上调，可能成为预测口腔鳞癌化疗疗效的标志物及潜在的治疗靶点。

关键词

口腔鳞癌 / 顺铂 / 化疗 / 耐药 / 差异基因 / 生物信息学

基金资助

深圳市科技创新委员会基础研究重点项目(NO:JCYJ20220818102816036)