成都市锦江区污水中猴痘病毒的监测及基因特征分析

摘要

目的 调查成都市锦江区污水中猴痘病毒含量，并对其进行分型溯源。方法 2023年7～9月对成都市第九污水处理再生水厂未经消杀处理的污水进行24 h间断采样，共采集26个样本。用聚乙二醇沉淀法将水样从105 mL浓缩到0.6 mL后，提取核酸，用实时荧光聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction, PCR)法检测猴痘病毒，用猴痘病毒假病毒标准物质制备标准曲线计算相对浓度。对阳性的样本进行猴痘病毒全基因组扩增子测序。结果 8个样本检测出猴痘病毒阳性，检出率30.8%,均为西非分支Ⅱb C.1型。各分离株基因与报道的临床阳性株非常相似，与2022年猴痘疫情暴发的基因组密切相关。各分离株序列之间也非常相似，相似性为99%以上。结论 污水中的猴痘病毒都与报道的临床毒株高度相似，可以推定污水中的猴痘病毒均来自于患者或携带者的人体脱落物或排泄物。污水中猴痘病毒浓度与阳性报告病例的发生率基本呈正相关，表明污水监测是监测猴痘感染传播趋势的可行方法。

关键词

猴痘病毒 / 污水 / 环境监测 / 扩增子测序