Tn5复合体的制备及细胞中染色质相互作用的检测

潘有福; 罗森; 金燕红

doi:10.14169/j.cnki.zunyixuebao.2025.0137

遵义医科大学学报 ›› 2025, Vol. 48 ›› Issue (11) : 1112 -1120. DOI: 10.14169/j.cnki.zunyixuebao.2025.0137

Tn5复合体的制备及细胞中染色质相互作用的检测

潘有福, 罗森, 金燕红

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摘要

目的为了丰富染色质相互作用检测手段以更好探究基因表达调控机制，在现有的染色质相互作用技术和理论基础上，利用Tn5转座系统，设计实验方案并检测染色质间的相互作用。方法本文制备了利用不同DNA接头组装的Tn5复合体，通过优化反应条件，以MCF7细胞中TFF1基因的增强子和启动子的模式相互作用为参考，检测其间的相互作用。结果我们设计的DNA接头与Tn5转座酶具有很好的相容性，Tn5复合体具备所需的生物学活性。结合Tn5和ChIP技术，经过检测模式基因已知的增强子和启动子间的染色质间相互作用，带有粘性末端的DNA接头可以检测到相互作用，不带粘性末端的DNA接头则没有预期的信号。结论结合Tn5和ChIP技术，利用有粘性末端的DNA接头，可以检测到染色质间的相互作用，从而为研究基因组的三维结构和基因调控提供了可供选择的技术手段。