转录组学分析揭示HMGB1在敌草快中毒肾损伤中的作用机制

摘要

目的 利用公共数据探讨高迁移率组蛋白参与敌草快（DQ）诱导急性肾损伤的分子机制。方法 GEO数据库在线分析并下载敌草快中毒（GSE27170）及HMGB1（GSE18721）的差异基因表达数据，GSE4607作为验证集。利用R语言对差异基因进行KEGG、GO、PPI、枢纽基因筛选，sangerbox网站进行免疫浸润分析，最后通过动物实验对HMGB1表达与敌草快中毒肾损伤进行初步验证。结果 鉴定出52个枢纽基因与免疫、氧化应激及代谢过程密切相关。通过MCC算法、PPI网络筛选及独立验证数据集验证后进一步筛选，得到4个枢纽基因（NQO1、GCLM、SRXN1、HMOX1）。将4个枢纽基因进行免疫浸润及相关性分析，发现NK细胞、B细胞与这些枢纽基因成呈正相关，其中以CD4⁺T细胞、M0巨噬细胞的相关性更高。最后，动物实验证实HMGB1表达在DQ中毒所致肾脏病理损害中起着重要作用。结论 NQO1、GCLM、SRXN1、HMOX1是DQ中毒及HMGB1的枢纽基因，通过调控氧化应激、代谢紊乱、细胞对毒物反应及免疫反应途径参与DQ诱导的AKI。

关键词

高迁移率组蛋白B1 / 敌草快中毒 / 急性肾损伤 / 转录组学 / 氧化应激