抗生素暴露对极早产儿出生后不同时间肠道菌群定植的影响

摘要

目的 探讨基于16S核糖体RNA(16S rRNA)基因测序技术动态监测抗生素治疗的极早产儿(VPI)出生后不同时间肠道菌群的定植及演变过程。方法 选取生后24 h内使用抗生素治疗的VPI(胎龄<32周)20例为研究对象，收集VPI的一般临床资料[性别、胎龄、出生体质量、分娩方式、胎盘/脐带/羊水情况、喂养方式、抗生素使用种类和持续时间、有无使用呼吸机和使用时间、住院时长，住院期间新生儿肺炎、脓毒症、新生儿呼吸窘迫综合征(RDS)、支气管肺发育不良(BPD)、新生儿颅内出血(IVH)及新生儿坏死性小肠结肠炎(NEC)的发生情况];收集VPI生后第1天(使用抗生素前，A0)、第3天(A1)、第1周(A2)、第1月(A3)及第3月(A4)的粪便标本，采用16S rRNA基因测序技术进行肠道菌群的生物信息学分析肠道菌群扩增子序列变异体(ASV)数目、Chao1指数、shannon指数、菌门和菌属变化特点及表型预测。结果 VPI肠道菌群ASV数目、Chao1指数及shannon指数A1时开始下降，随着抗生素的停用及日龄的增加有所恢复；变形菌门相对丰度先增加后减少，厚壁菌门相对丰度先减少后增加，放线菌门在生后处于稳定的低丰度状态、A4时迅速增加；菌属演替依次为明串珠菌属及克雷伯菌属、双歧杆菌属；刚出生时最先定植的是需氧菌和兼性厌氧菌，A4时厌氧菌和兼性厌氧菌成为优势菌群。结论 VPI生后抗生素暴露可能会降低肠道菌群的丰富度及多样性，生后3个月内肠道菌群组成结构、相对丰度及表型不断变化。

关键词

早产 / 表型 / 极早产儿 / 抗生素 / 肠道菌群 / 定植 / 多样性 / 16S核糖体RNA