snx8a基因在早期斑马鱼胚胎中空间和时间特异性表达

摘要

目的 探索snx8a基因在斑马鱼早期胚胎中的表达情况。方法 使用Snap Gene 6.0.2软件对由NCBI数据库上拷贝的人类SNX8、斑马鱼Snx8a和Snx8b氨基酸序列进行氨基酸序列比对，利用转化连接、TA克隆等分子生物学方法构建原位杂交探针质粒；通过收集不同发育时相的野生斑马鱼胚胎进行全胚胎原位杂交，观察斑马鱼早期胚胎中snx8a的空间表达情况、使用RT-qPCR检测斑马鱼早期发育不同时期snx8a基因的表达情况。结果 氨基酸序列比对结果显示斑马鱼Snx8a较Snx8b与人的SNX8同源性更高；对构建的原位杂交探针质粒双酶切鉴定及测序结果显示，构建的探针质粒序列正确、质粒可用；全胚胎原位杂交结果显示，斑马鱼snx8a基因在胚胎一细胞期就开始表达，之后特异表达于斑马鱼头部及尾部造血区；RT-qPCR结果显示，snx8a基因表达逐渐升高，在胚胎12 hpf时达到峰值(P<0.05)。结论 斑马鱼snx8a基因为母源性基因，其可能与斑马鱼神经发育和造血发育相关。

关键词

斑马鱼 / snx8a基因 / 生物信息学分析 / 全胚胎原位杂交 / 胚胎发育

基金资助

国家自然科学基金资助项目(32160168,32260177); 贵州省科技创新人才团队项目(CXTD[2021]002); 贵州省百层次人才项目(黔科合平台人才-GCC[2023]034); 贵州省科技厅基础研究计划(黔科合基础-ZK[2024]一般143)