神经母细胞瘤中染色质重塑基因的预后价值及其与肿瘤免疫微环境特征的关系

摘要

目的 通过识别与神经母细胞瘤(NBL)预后相关的染色质重塑基因(CRRGs),构建预测风险模型，并探讨其与肿瘤免疫微环境的相互作用。方法 通过GSE85047和TARGET-NBL数据库对276例NBL样本的生存和基因表达数据进行分析，通过单变量和多变量Cox回归分析筛选预后基因；使用LASSO回归构建预测风险模型，去掉276例样本中缺失完整临床信息的7例，再分为高风险组(n=134)与低风险组(n=135),并通过受试者工作特征(ROC)曲线分析进行验证；采用免疫浸润分析和功能富集研究分析CRRGs相关的预后基因与肿瘤免疫反应的关系；实时荧光定量反转录PCR(RT-qPCR)验证对照组(正常组织，n=5)与NBL组(NBL组织，n=5)的候选CRRGs表达水平。结果 通过数据库分析筛选出5个CRRGs作为NBL显著的预后标志物，包括BAZ1A、CHAF1A、CHD4、CHRAC1及CHD3;风险模型在1年、3年和5年的生存预测中显示出高准确性，ROC曲线下的面积(AUC)分别为0.78、0.81和0.87;高风险组与低风险组之间的免疫细胞浸润和通路激活存在显著差异(P<0.05);RT-qPCR结果证实NBL组织中BAZ1A、CHAF1A、CHD3和CHRAC1显著上调(P<0.05)。结论 CRRGs在NBL中起着重要作用，并建立了有效的风险预测模型，为NBL的分子机制和潜在治疗策略提供新见解。

关键词

神经母细胞瘤 / 染色质重塑基因 / 预后生物标志物 / 风险模型 / 免疫微环境

基金资助

贵州省科技厅基础研究计划项目(黔科合基础-zk[2022]一般418、黔科合基础-zk[2023]一般368)