基于高通量宏基因组学测序的贵州酸汤不同生产方式下的微生态差异分析

幸欣; 晏春春; 王颜颜; 罗罡; 袁军; 康颖倩

doi:10.19367/j.cnki.2096-8388.2026.09.007

贵州医科大学学报 ›› 2026, Vol. 51 ›› Issue (9) : 1298 -1306. DOI: 10.19367/j.cnki.2096-8388.2026.09.007

基于高通量宏基因组学测序的贵州酸汤不同生产方式下的微生态差异分析

幸欣, 晏春春, 王颜颜, 罗罡, 袁军, 康颖倩

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摘要

目的探究工厂制作与手工制作对贵州酸汤微生物群落及代谢功能的影响，解析不同生产方式下核心菌群与差异菌群(即分组特征微生物标志物)的差异化响应特征。方法采集贵州4个地区共10份酸汤样品，通过分离纯化及宏基因组学测序，比较两种制作方式的微生物差异。结果分离纯化显示，手工制作酸汤中筛选到植物乳植杆菌(L.plantarum)、副干酪乳酪杆菌(L.paracasei)等；工厂制作酸汤中筛选到L.plantarum等；宏基因组学表明，不同工艺下发酵菌群的丰富度和多样性相对稳定。工厂制作优势菌为耐酸乳杆菌(L.acetotolerans,15.4%)、洛旺醋杆菌(A.lovaniensis,7.83%);手工制作为L.plantarum(12.6%)、L.paracasei(7.12%);差异判别分析(LEfSe)显示工厂制作差异菌群为假单胞菌属等环境来源微生物，手工制作为乳酸菌相关菌群；KEGG功能注释表明，手工制作富集芳香化合物降解和次级代谢合成通路；工厂制作样品中富集了与真核微生物功能基因相关的KEGG通路(如MAPK signaling pathway-yeast和cell cycle-yeast),该富集仅反映样品中真菌基因拷贝数较高，不代表真菌群落处于活跃增殖状态。结论生产方式主要影响酸汤中差异菌群的种类和丰度、优势种丰度及代谢特征，未改变以乳酸菌为核心的微生态基础；工厂制作样品中检测到较高相对丰度的环境微生物类群(如假单胞菌属、不动杆菌属)。