一起腹泻疫情病原体鉴定及腺病毒F41型基因组遗传特征分析

摘要

目的 鉴定引起山东省泰安市某学校腹泻疫情的病原体，并对其基因组进行遗传特征分析。方法 利用荧光定量PCR方法对本起疫情中收集到的19份腹泻患者及餐厅工作人员的肛拭子、环境样本进行常见腹泻病毒性病原体检测，随后利用高通量测序方法获得阳性样本的病毒基因组序列，并对病毒全基因组序列进行核苷酸和氨基酸序列相似性比较、系统发育分析。结果 19份样本中有7份样本被鉴定为腺病毒阳性，阳性检出率为36.8%；在患者10和患者4餐具样本中测序获得了腺病毒F41型毒株的全基因组序列，两株病毒核苷酸、氨基酸相似性均为100%。基于全基因组、六邻体基因、纤突蛋白基因的系统发育分析表明，本研究的HAdV-F41毒株与中国、美国、日本、伊拉克等国家分离到的毒株亲缘性较高。结论本次泰安地区儿童腹泻疫情是由腺病毒F41型感染引起，且与中国、美国等毒株亲缘性较高，丰富了山东省腺病毒F41型毒株的遗传特征资料，为腺病毒引起的儿童腹泻的防治提供了理论依据。

关键词

腺病毒F41亚型 / 腹泻 / 高通量测序 / 遗传特征分析